Bisher konnte der Schüler Ittoki Sakuraba ein ganz normales Leben führen. Doch dann wird er plötzlich von einem Ninja des Kouga-Clans angegriffen und alles verändert sich schlagartig. Ittoki erfährt, dass er der neunzehnte, legitime Erbe des Iga-Clans ist, der seit langem einen ebenso erbitterten wie geheimen Krieg gegen die Kouga-Ninjas führt. Nun muss er schnell lernen, was es heißt, ein richtiger Ninja zu werden, denn nur so kann er gegen die Gefahren, die ihn erwarten, bestehen.