Als der 17 jährige Shinichi Kudo mit seiner Klassenkameradin Ran Mori im Vergnügungspark war, beobachtete er wie zwei Männer in Schwarz einen verdächtigen Deal machten. Shinichi war so auf das Geschehen konzentriert, dass er den Mann der sich hinter ihm anschlich nicht bemerkte und niedergeschlagen wurde. Sie verabreichten ihm ein Gift und als er aufwachte war er geschrumpft. Seit diesem Tag will er diese kriminelle Organisation aufdecken und löst die kniffligsten Rätsel, um an sein Ziel zu kommen. Auch wenn er im Körper eines Grundschülers gefangen ist, hat hat er immer noch den Verstand eines 17 jährigen behalten. Man nennt ihn Detektiv Conan.