Kirie Goshima lebt mit ihrer Familie in der kleinen Stadt Kurouzo-chou. Ihr Leben verläuft ereignislos, bis sich eines Tages merkwürdige Ereignisse zu häufen beginnen. Zunächst sind es nur Muscheln, die in einem bestimmten Muster angeordnet sind, sowie Wirbel im Wasser und in der Luft. Laut Shuuichi Saitou, Kiries Freund, stehen sie alle in Verbindung mit einem Phänomen, das ihre Heimatstadt heimsucht: Uzumaki, die geheime Form, welche die gesamte Welt verändern kann. Bald schon beginnen auch die Menschen sich sonderbar zu verhalten, als die Spiralformen immer häufiger auch auf ihren Körpern zu finden sind. Bevor sie es verhindern können, droht die gesamte Stadt in Chaos und Wahnsinn zu versinken, gefangen in einem Strudel, aus dem es kein Entkommen gibt.