Hikaru Shidou, Umi Ryuuzaki und Fuu Hououji werden während eines Besuchs des Tokyo Towers in die magische Welt Cephiro gerufen.

Dort erfahren die drei Mädchen von Prinzessin Emeraude, dass sie als Magic Knights auserwählt wurden, das Schicksal der fremden Welt zu verändern.